Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms