Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC4Q9NPP4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC4Q9NPP4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms