Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX17Q9H6I2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX17Q9H6I2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms