Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOJQ9H4E5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms