Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK3Q9H422 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms