Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LINC00597Q9H2U6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms