Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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HOXD1Q9GZZ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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HOXD1Q9GZZ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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HOXD1Q9GZZ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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HOXD1Q9GZZ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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HOXD1Q9GZZ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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HOXD1Q9GZZ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD1Q9GZZ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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HOXD1Q9GZZ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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