Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR12Q9C0I1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms