Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM6SF1Q9BZW5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms