Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CARD11Q9BXL7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CARD11Q9BXL7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms