Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms