Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ24

ZFYVE21, Zinc finger FYVE domain-containing protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE21Q9BQ24 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFYVE21Q9BQ24 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFYVE21Q9BQ24 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms