Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRQ99707 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTRQ99707 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTRQ99707 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRQ99707 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRQ99707 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRQ99707 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRQ99707 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRQ99707 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRQ99707 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRQ99707 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRQ99707 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRQ99707 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRQ99707 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRQ99707 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRQ99707 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRQ99707 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRQ99707 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRQ99707 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRQ99707 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRQ99707 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRQ99707 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTRQ99707 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRQ99707 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRQ99707 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRQ99707 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRQ99707 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRQ99707 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRQ99707 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRQ99707 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRQ99707 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRQ99707 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRQ99707 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRQ99707 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRQ99707 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRQ99707 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRQ99707 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRQ99707 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms