Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUP88Q99567 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP88Q99567 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms