Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN18Q96SJ8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms