Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RILPQ96NA2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms