Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL15Q96M94 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms