Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFAP53Q96M91 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFAP53Q96M91 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFAP53Q96M91 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms