Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
COG3Q96JB2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms