Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZNF496Q96IT1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF496Q96IT1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms