Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BICD1Q96G01 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BICD1Q96G01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms