Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms