Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms