Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC51Q96ER9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC51Q96ER9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms