Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEURL3Q96EH8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEURL3Q96EH8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms