Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF25Q96BH1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF25Q96BH1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms