Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC17Q96AE7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms