Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A3Q93084 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A3Q93084 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms