Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP13Q92995 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP13Q92995 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP13Q92995 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP13Q92995 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP13Q92995 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP13Q92995 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP13Q92995 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP13Q92995 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP13Q92995 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP13Q92995 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP13Q92995 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP13Q92995 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP13Q92995 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP13Q92995 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP13Q92995 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP13Q92995 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP13Q92995 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP13Q92995 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP13Q92995 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms