Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3AQ92484 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3AQ92484 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms