Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71DQ8N9W8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71DQ8N9W8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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