Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF3Q8N9W5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms