Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBL4BQ8N7F7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL4BQ8N7F7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms