Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PROM2Q8N271 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PROM2Q8N271 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms