Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOT2Q8IXI1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms