Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms