Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms