Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRX1Q86UT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRX1Q86UT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms