Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF554Q86TJ5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms