Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms