Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE4Q6UWF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE4Q6UWF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms