Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGMBQ6NW40 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms