Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCSD1Q6JBY9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCSD1Q6JBY9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCSD1Q6JBY9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms