Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SFRP4Q6FHJ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms