Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf53Q5VUE5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms