Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01545Q5VT33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms