Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HP1BP3Q5SSJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms