Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CRB2Q5IJ48 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRB2Q5IJ48 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms