Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A4Q5BKX6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms