Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms